P/s. Совет. Если стоишь в очереди на квартиру (постоянное жилье) и служишь в Москве (Питере) или области, то я бы не спешил переходить на ипотеку, т.к. на доп. выплаты ничего не купишь. Все зависит от того, где собираешься брать жилье. Можешь прикинуть. При хорошем раскладе, получишь примерно 1,6 - 1,9 млн. доп. выплат. Вот и думай.

Да, и еще: ВАЖНО! чтобы получить доп. выплаты, участник накопительно-ипотечной системы или член его семьи не должны являться нанимателями жилых помещений по договорам социального найма либо членами семьи нанимателя жилого помещения по договору социального найма или собственниками жилых помещений либо членами семьи собственника жилого помещения.

В твоем случае, вижу это так:
1. Встать на ипотеку.
2. Дождаться ОШМ.
3. После издания приказа об увольнении тебя по ОШМ подать рапорт (и соответствующие документы к нему) на получение дополнительных денежных средств.

В соответствии с Приказом МО №77 дополнительные денежные средства выплачиваются в трехмесячный срок со дня поступления рапорта. На практике - пока анализ провести невозможно, мало фактов.

P.s. И почему не прописывают при части? Странная какая-то у ваших логика...точнее никакой. Вообще-то должны прописать. И на служебку поставить тоже.
Сходи в жилгруппу, спроси чем они обосновывают такой подход к вопросу о прописке.

Выписать тебя в никуда не могут, - это если ты собрался ехать выписываться из подмосковного коттеджа Поэтому когда у тебя будет куда прописаться, например, при части, то тебе просто надо будет собрать комплект документов (рапорт, справки всякие, заполнить квитанции и т.д. т.п), прийти в паспортный стол и тебе сразу поставят 2 штампа: 1-ый - о снятии с регистрационного учета (по уведомлению). Вышлют в подмосковье встречную выписку; 2-ой - регистрацию (прописку) при части.

Но! Думаю, для подстраховки, дождаться, когда тебя включат в реестр участников НИС (по возможности). А потом писать рапорта 2), 3).